เรื่องย่อ : หนึ่งปีหลังจาก [กล่องแห่งลาพลัส] ได้ถูกเปิดออก การมีอยู่ของ [กฎบัตรศักราชอวกาศ] ที่กล่าวถึงสิทธิและการมีอยู่ของ Newtype ได้รับการเปิดเผย กระนั้นพลวัตรของโลกก็ไม่ได้เปลี่ยนแปลงอะไรมากนัก ความขัดแย้งที่เรียกว่า [กรณีลาพลัส] (Laplace Incident) ก็ดูเหมือนจะจบลงไปพร้อมกับการล่มสลายของเหล่าเดนสงครามซีออน (กลุ่มปลอกแขนเสื้อ) เมื่อคราวสงครามครั้งก่อน และ Unicorn Gundam ทั้งสองเครื่อง อันเป็นโมบิลสูทที่เป็นตัวละครหลักของความขัดแย้งนี้ ก็ได้ถูกประเมินว่าเป็นอันตราย และถูกผนึกไว้เป็นความลับ เพราะพวกมันเผยให้เห็นถึงพลังอำนาจที่ก้าวล้ำความเข้าใจของมนุษยชาติไป อย่างไรก็ตาม RX-0 Unicorn Gundam 03 ซึ่งได้หายตัวไปสองปีก่อน และเลือนหายไปจากหน้าประวัติศาสตร์ ก็ได้ปรากฎตัวขึ้นบนโลกอีกครั้ง เครื่องจักรดังกล่าวมีชื่อว่า “Phenex” ซึ่งเป็นที่จับตาของผู้คนที่เกี่ยวข้อง ไม่ว่าจะเป็น กองกำลังฝ่ายสหพันธ์โลก และกลุ่มปลอกแขนเสื้อ,Luio & Co, องค์กรใหญ่ที่มีสายสัมพันธ์แน่นแฟ้นกับ Anaheim Electronics มีความเกี่ยวข้องกับ Phenex อย่างลึกซึ้ง ในฐานะ Luio & Co. ที่ปล่อยโมบิลสูทตัวใหม่อย่าง Narrative Gundam ออกมา เป้าหมายที่แท้จริงของพวกเขาคืออะไรกันแน่…?